Els òrgans de govern de la SGAE estan compostos pels mateixos creadors, elegits per governar l’entitat. La direcció de la SGAE recau en la seva junta directiva, òrgan de govern i representació de la societat composta per 39 membres, socis de l’entitat i distribuïts en el Col·legi de Gran Dret, Col·legi de Petit Dret, Col·legi Audiovisual i Col·legi d’Editors Musicals. L’administració permanent i executiva de l’entitat correspon al consell de direcció. D’aquest consell depèn l’equip directiu i tècnic de la SGAE, format per més de 400 treballadors.